Двойное геномное секвенирование при лейкозе: анализ раковых клеток и зародышевой линии

Перейти к разделу

• Зачем проводить секвенирование и раковых, и нормальных клеток
• Материал для секвенирования раковых клеток
• Растущая важность секвенирования зародышевой линии
• Как выполняется секвенирование зародышевой линии
• Клинические последствия выявления наследственного рака
• Прецизионная медицина в действии

Зачем проводить секвенирование и раковых, и нормальных клеток

Геномное секвенирование, включая секвенирование нового поколения (NGS) и полное экзомное секвенирование (WES), стало стандартом в онкологии. Доктор Шай Израэли, MD, подчеркивает необходимость секвенирования двух типов клеток: опухолевой ткани из биопсии и нормальных клеток пациента. Этот двойной подход лежит в основе современной прецизионной медицины, поскольку значительная часть онкологических заболеваний имеет наследственную природу. Данные, полученные при секвенировании обоих образцов, крайне важны для подбора эффективного лечения и оценки риска развития рака у ближайших родственников пациента.

Материал для секвенирования раковых клеток

У пациентов с лейкозом для геномного секвенирования обычно используют клетки из биопсии костного мозга или периферической крови. Как объясняет доктор Шай Израэли, MD, крайне важно секвенировать именно лейкемические клетки, чтобы выявить драйверные мутации, такие как аномалия BCR-ABL, характерная для филадельфий-хромосомо-положительного лейкоза. Эти приобретённые мутации специфичны для рака и служат основными мишенями для прецизионной терапии. Обогащение образца раковыми клетками — необходимый шаг для обеспечения точности данных NGS и их клинической значимости при диагностике и выборе лечения.

Растущая важность секвенирования зародышевой линии

Помимо опухолевых клеток, всё большее значение в онкологии приобретает секвенирование зародышевой линии. Доктор Шай Израэли, MD, указывает на растущее число доказательств ключевой роли генетики как в детских, так и во взрослых раках. Исследования показывают, что до 15% онкологических заболеваний у детей имеют наследственный компонент. Это открытие крайне важно для планирования лечения, особенно при рассмотрении трансплантации костного мозга от родственного донора, который также может быть носителем той же предрасполагающей мутации. Секвенирование зародышевой линии даёт полную генетическую картину, необходимую для безопасности пациента и его семьи.

Как выполняется секвенирование зародышевой линии

Секвенирование зародышевой линии анализирует унаследованную ДНК пациента, которую оптимально получать из неопухолевых клеток. При раках крови, как отмечает доктор Шай Израэли, MD, распространённым источником является биопсия кожи для культивирования фибробластов. Эта процедура часто легко встраивается в план лечения детей, которые регулярно проходят анестезию для установки центрального венозного катетера для химиотерапии. Взяв небольшой образец кожи во время этой безболезненной процедуры, clinicians могут получить чистую нормальную ДНК для анализа зародышевой линии методом NGS, обеспечивая комфорт для юного пациента.

Клинические последствия выявления наследственного рака

Выявление наследственного ракового синдрома с помощью секвенирования зародышевой линии имеет немедленные и долгосрочные клинические последствия. Как подробно излагает доктор Шай Израэли, MD, эта информация может напрямую влиять на интенсивность лечения и выбор донора стволовых клеток, предотвращая использование сиблинга, который также является носителем высокорисковой мутации. Более того, обнаружение предрасполагающей мутации позволяет проводить генетическое консультирование и тестирование членов семьи. Такой проактивный подход обеспечивает раннее выявление и профилактические стратегии для родственников из группы риска, кардинально меняя траекторию здоровья всей семьи.

Прецизионная медицина в действии

Практика секвенирования как опухолевых, так и нормальных тканей является воплощением прецизионной медицины. Доктор Шай Израэли, MD, описывает этот двойной подход как мощный инструмент, который привёл к впечатляющим случаям излечения, включая недавние успехи в его центре. Всесторонне анализируя генетический ландшафт — как приобретённые мутации в лейкемических клетках, так и унаследованные мутации в ДНК зародышевой линии — онкологи могут оказывать высоко персонализированную и эффективную помощь. Эта стратегия гарантирует, что лечение направлено не только против рака, но и безопасно с учётом полного генетического наследия пациента.

Полная расшифровка

Геномное секвенирование (NGS, WES) опухолей стало обычной практикой. Но зачем нужно секвенировать и опухолевую ткань из биопсии или резекции, и нормальные клетки пациента (часто из клеток кожи, фибробластов)? Значительная часть раков имеет наследственную природу. Данные NGS могут быть важны как для лечения, так и для других членов семьи.

Доктор Антон Титов, MD: Вы проводите геномное секвенирование нового поколения (NGS) клеток детского лейкоза. Что служит материалом для секвенирования? Клетки периферической крови? Биопсия костного мозга?

Доктор Шай Израэли, MD: Это сложный вопрос, и я разделю его на две части. Я привёл пример филадельфий-подобных или филадельфийских лейкозов с аномалиями BCR-ABL. Эти генетические мутации (хромосомные транслокации) обнаруживаются в лейкемических клетках. Крайне важно секвенировать именно раковые клетки.

Доктор Антон Титов, MD: Нужно ли обогащать клетки для секвенирования нового поколения (NGS) рака?

Доктор Шай Израэли, MD: Да. Позже я приведу удивительный пример излечения ребёнка от рака, который недавно наблюдался в нашем центре. Этот случай также демонстрирует важность секвенирования генов опухоли.

Кроме того, становится всё более важным и другое. Мы узнаём, что генетика играет всё большую роль в развитии опухолей как у детей, так и у взрослых.

Мы полагаем, что до 15% раков у детей имеют наследственный компонент. Это важно! Потому что может потребоваться трансплантация костного мозга от брата или сестры. Но они также могут иметь предрасполагающую мутацию.

Всё чаще мы теперь также секвенируем зародышевую линию. Зародышевая линия — это не сами лейкемические клетки. При раке крови мы часто секвенируем клетки кожи. Мы секвенируем клетки кожи из культуры фибробластов.

Биопсии кожи у детей берут довольно часто. Потому что мы устанавливаем центральные венозные катетеры для лечения рака у детей. Центральные венозные катетеры устанавливаются под анестезией. Мы считаем, что это безболезненная процедура; мы делаем всё под анестезией. Затем мы также берём биопсию кожи.

Всё чаще мы проводим секвенирование зародышевой линии из кожи. Мы выявляем наследственные формы рака в семье. Мы секвенируем оба типа тканей. Мы проводим секвенирование раковых лейкемических клеток из костного мозга. Мы также секвенируем нормальные клетки из зародышевой линии. Они обычно берутся из кожных фибробластов.

Доктор Антон Титов, MD: Это настоящие примеры прецизионной медицины! Да.